Η κορυφαία στιγμή μέχρι τότε ήρθε τη σεζόν 2016-17, όταν η Δόξα αγωνίστηκε για πρώτη φορά στην κορυφαία κατηγορία του ελληνικού μπάσκετ (Basket League), γράφοντας ιστορία ως η πρώτη ομάδα από τα Ιόνια Νησιά που έφτασε στο υψηλότερο επίπεδο.
Η σεζόν 2025-26 αποτέλεσε νέο ιστορικό ορόσημο. Η Δόξα κατέκτησε το πρωτάθλημα της Elite League, εξασφάλισε την άνοδο στη Stoiximan GBL και κατέκτησε το UNICEF Trophy, ολοκληρώνοντας μια από τις σημαντικότερες σεζόν στην ιστορία της. Το 2026 σηματοδοτεί μια νέα εποχή. Η Δόξα Λευκάδας λειτουργεί πλέον ως ΚΑΕ και επιστρέφει στην κορυφαία κατηγορία του ελληνικού επαγγελματικού μπάσκετ.